NORGEN社 土壌・環境水からの核酸抽出キット
スピンカラムを利用した各種のRNA、DNA精製キットを販売していますNorgen社より、土壌、環境水から核酸を抽出するキットが発売されました。
本キットで抽出した核酸は、メタゲノム解析などのアプリケーションに利用いただけます。
Soil DNA Isolation Kit 土壌中のtotal DNAの抽出
特長
- 土壌中のすべての細菌、真菌、藻類からtotal DNAを抽出
- 表土、培養土、粘土、砂質土などさまざまな土壌から抽出可能
- 腐植酸などのPCR阻害物質を除去し、高品質なDNAを抽出
- total DNAがフェノール・クロロホルムフリーで抽出可能
使用例
土壌から抽出したサンプルを精製して得た、DNAをテンプレートにして原核生物ITSプライマーでPCRを行いました。
図1. 3種類の土壌からの腐植酸の除去
A. 腐植酸の除去。サンプルの水色が茶色から無色透明になっていることで、腐植酸の除去が確認できます。
B. PCR結果。腐植酸などPCR阻害物質が除去されているので、原核生物由来のDNAの増幅が確認できます。
Water RNA/DNA Purification Kit 環境水中のtotal RNAとtotal DNAの抽出
特長
- 水中の細菌、真菌、藻類などすべての微生物からtotal RNAとtotal DNAを抽出
- 1カラムでRNAとDNAのどちらも同時に抽出
- 高品質なRNA、DNAを抽出、そのまま次のアプリケーションに使用可能
- microRNAを含むすべてのRNAおよびDNAが、フェノール・クロロホルムフリーで抽出可能
使用例
図2.サンプル水から抽出したRNAとDNAの電気泳動
本キットで抽出したRNAとDNAをそれぞれ電気泳動しました。
A. 抽出したDNA 10 μlを1% TAEアガロースゲルにアプライし、泳動しました。
M. マーカー。
B. 抽出したRNA 5 μlを1.5% ホルムアルデヒド-アガロースゲルにアプライし、泳動しました。
高品質のRNAとDNAが高収量で抽出できています。
図3.リアルタイムPCRによる、大腸菌16S rDNAの検出
大腸菌を50 mlの水に懸濁し、指数増殖期のときに本キットを用いてRNAとDNAを抽出しました。その後、大腸菌16S rDNAプライマーを用いてリアルタイムPCRを行いました。
1 mlあたりのコロニー形成単位(cfu/ml)すべての密度において、大腸菌16S rDNAの検出に成功しています。また、高品質のRNAとDNAが高収量で抽出できています。これらのことから、水中微生物の高感度検出が可能なことが示唆されます。
製品仕様
項目 | Soil DNA Isolation Kit | Water RNA/DNA Purification Kit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精製できる核酸 | total DNA | total RNA、total DNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
サンプル処理量 | 土壌、250 mg | 水、10〜100 ml | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10サンプルの精製時間 | 30分 | 45分 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
カラム容量 | スピンカラム:600 μl | フィルターカラム:600 μl スピンカラム:100 μl |
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アプリケーション |
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RNA:定量リアルタイムRT-PCR、RT-PCR、ノザンブロッティング |
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キット内容 |
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使用方法 フローチャート |