エピジェネティクス研究に最適

EpiCypher 社 CUTANA CUT&Tag キット

EpiCypher 社では、ChIP-seq に代わる CUT&RUN や CUT&Tag アッセイで使用するキット・試薬を販売しています。 CUT&RUN や CUT&Tag は、クロマチン免疫沈降法に依存しないエピゲノム解析技術で、少数の細胞の解析に向いています。

ここでは、CUT&Tag キット / ライブラリー調製キットを紹介します。

CUTANA CUT&RUN キットはこちら

特長

CUT&RUN / CUT&Tag は ChIP-seq と比較して

ライブラリー調製までにかかる時間が大幅に短縮
DNA-タンパク質の架橋、DNA の断片化、免疫沈降（IP）が不要
高品質な解析結果を少ない細胞数、シーケンスリード数で入手可能

■ シーケンスデータ解析までのフロー

CUT&RUN および CUT&Tag は、ChIP seq と比べて、ライブラリー調製までの時間を大幅に短縮できます。

■ シーケンスデータ解析結果（CUT&Tag、CUT&RUN、ChIP-seq）

CUT&RUN および CUT&Tag は、少ないシーケンスリード数で高品質のシーケンス解析が可能です。

■ CUT&RUN / CUT&Tag どちらを選択すればいい?

EpiCypher 社では、ターゲットに限らず、まずは CUT&RUN で解析することを推奨しています。 CUT&RUN は幅広い細胞タイプ、固定の条件、ターゲットに対応しています。CUT&Tag は、固定処理を行っていない native な細胞で、ターゲットがヒストン PTM（ヒストン翻訳後修飾）の場合に最適です。それぞれの特徴を下表に示します。

特徴	ChIP-seq	CUTANA CUT&RUN	CUTANA CUT&Tag
サンプル	断片化クロマチン	細胞もしくは核	核（推奨）
必要な細胞数	> 1,000,000 個	500,000 個	100,000 個
ターゲット	ヒストン PTM、転写因子	ヒストン PTM、転写因子、クロマチンリモデリング因子	ヒストン PTM
二次抗体	不要	不要	必要
ライブラリーの準備	必要	必要	不要（ダイレクト PCR）
作業日数（細胞→ライブラリー調製）	< 1 週間	< 3 日	< 2 日
シーケンス深度	> 3,000 万	300～500 万	500～800 万
S/N 比	低い	高い	高い
スループット性	低い	高い	高い

製品説明
価格表

製品説明

CUTANA CUT&Tag キットには、ライブラリー調製までに必要な試薬が含まれており、簡便にシーケンス解析が行えます。ヒストン PTM の研究に最適で、また DNA 切断と同時にアダプターを挿入するためライブラリー調製が簡略化されます。

CUT&Tag シーケンスデータ

CUT&Tag アッセイでは、さまざまなヒストン PTM に対し高品質なシーケンスデータが得られます。

アッセイフロー

キット構成

■ CUTANA CUT&Tag キットの主な構成品

ConA Beads
細胞固定用ビーズ

H3K27me3 Positive Control Antibody
Rabbit IgG Negative Control Antibody
Anti-Rabbit Secondary Antibody
ネガティブ / ポジティブコントロール抗体 / 二次抗体

SNAP-CUTANA K-MetStat Panel
コントロールとして、リジン残基をメチル化した 15 種類の PTM および未修飾のものに、DNA バーコードを付与したデザインヌクレオソームが含まれています。

pAG-Tn5
抗体結合クロマチンの DNA を選択的に切断し、同時にアダプターでタグ付けを行います。

Multiplexing Primers
Non-Hot Start 2X PCR Master Mix
SPRIselect reagent manufactured by Beckman Coulter, Inc.
8-strip Tubes
4.5 M NaCl
0.5 M EDTA
1 M MgCl₂
SDS Release Buffer
SDS Quench Buffer
0.1X TE Buffer
Pre-Wash Buffer
Pre-Nuclear Extraction Buffer
Bead Activation Buffer
5% Digitonin
1 M Spermidine
Illumina シーケンシング用の調製試薬が含まれています。二つのプライマーセット（Set 1 および Set 2）を販売しており、最大 96 サンプルの同時解析が可能です。SPRIselect reagent は磁気ビーズで、シーケンスライブラリー調製で必要な DNA 断片のサイズセレクションを行います。

Illumina は Illumina, Inc. の登録商標です。

価格表

製品名	毒劇物	メーカー製品番号	容量	オンラインカタログへ
CUTANA CUT&Tag Kit (Primer Set 1)	毒	14-1102	48 reactions
CUTANA CUT&Tag Kit (Primer Set 2)	毒	14-1103	48 reactions

製品名	メーカー製品番号	容量	オンラインカタログへ
Magnetic Separation Rack, 0.2 mL Tubes	10-0008	1 rack
Magnetic Separation Rack, 1.5 mL Tubes	10-0012	1 rack